Návštěvníci se mohou těšit na nejrůznější exponáty a modely lidského ucha a srdce nebo na sochu pravěkého člověka v životní velikosti. Asi nejcennějším exponátem expozice je model kompletní kostry neandrtálce, kterou muzeum zakoupilo v USA. Právě tato kostra byla předlohou pro vytvoření repliky neandrtálce, asi čtyřicetiletého muže, který měří 182 centimetrů a v reálném životě by vážil přibližně 90 kilogramů.

První antropologická expozice byla v Humpolci instalovaná u příležitosti 100. výročí narození světoznámého antropologa a humpoleckého rodáka Aleše Hrdličky v roce 1969 a posledních 30 let byla bez obměny. Současná expozice odráží nejnovější antropologické poznatky a její realizace byla zahájena koncem roku 2017. Ukončena byla letos, v roce 150. výročí narození Aleše Hrdličky. Realizace nové antropologické expozice byla podpořena Krajem Vysočina v rámci programu Klenotnice Vysočina 2017.